Structurile interne asigură funcționarea democratică, transparentă și eficientă a Partidului Sol Invictus, oferind un cadru organizat pentru realizarea obiectivelor politice și sociale. Iată o listă a principalelor structuri interne.

1. Comisia de Arbitraj
Comisia de Arbitraj este responsabilă cu asigurarea respectării Statutului și a regulamentelor partidului. Aceasta analizează și soluționează conflictele interne, sancțiunile disciplinare și alte probleme care pot apărea între membrii partidului sau între structurile acestuia.

• Comisia este formată din membri aleși de Convenția Națională, recunoscuți pentru imparțialitate și integritate.
• Deciziile Comisiei sunt obligatorii pentru toate organizațiile și membrii partidului.

Comisia Națională de Arbitraj este organul de jurisdicție internă constituit la nivel național potrivit legii partidelor politice. 

Comisia Națională de Arbitraj este constituită din 11 membri ai PARTIDULUI SOL INVICTUS și 2 supleanți care sunt aleși prin vot secret de către Convenția Națională pentru un mandat de 4 ani. 

Modalitățile de organizare si funcționare a Comisiei Naționale de Arbitraj sunt stabilite prin regulament aprobat de Comisie. 

Comisia Națională de Arbitraj are următoarele atribuții :

a) analizează reclamațiile primite împotriva membrilor PARTIDULUI SOL INVICTUS care exercită o demnitate publică, cu respectarea dreptului de opinie al tuturor părților și a dreptului la apărare, și propune  Biroului Național aplicarea de sancțiuni împotriva acestora, dacă este cazul; 

b) soluționează, cu respectarea dreptului de opinie al tuturor părților și a dreptului la apărare, diferendele între organismele de conducere, de la nivel național, ale PARTIDULUI SOL INVICTUS sau între membrii PARTIDULUI SOL INVICTUS și organismele de conducere de la nivel național, ale PARTIDULUI SOL INVICTUS; 

c) soluționează, cu respectarea dreptului de opinie al tuturor părților și a dreptului la apărare, contestațiile împotriva sancțiunilor dispuse de Biroul Național sau birourile județene;

d) soluționează, cu respectarea dreptului de opinie al tuturor părților și a dreptului la apărare, contestațiile referitoare la modul de constituire a organelor de conducere de la nivelul organizațiilor județene sau a celui național.

e) soluționează, cu respectarea dreptului de opinie al tuturor părților și a dreptului la apărare, contestațiile cu privire la respingerea cererilor de primire în partid și a celor de transfer care nu pot fi soluționate la nivel județean.

f) soluționează, cu respectarea dreptului de opinie al tuturor părților și a dreptului la apărare, contestațiile cu privire la respingerea sau admiterea cererilor de primire în partid făcute de persoane din interiorul partidului împotriva celor care au depus cerere de aderare la partid, care nu pot fi soluționate la nivel județean.

g) se îngrijește de respectarea în interiorul partidului a valorilor și principiilor etice de corectitudine, egalitate, transparență, integritate și competență.